MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017393	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825445
2	NC_017393	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387825445
3	NC_017393	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
4	NC_017393	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825445
5	NC_017393	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825445
6	NC_017393	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825445
7	NC_017393	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825445
8	NC_017393	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825445
9	NC_017393	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387825445
10	NC_017393	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825445
11	NC_017393	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825445
12	NC_017393	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
13	NC_017393	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825445
14	NC_017393	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825445
15	NC_017393	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825445
16	NC_017393	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825445
17	NC_017393	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
18	NC_017393	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825445
19	NC_017393	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825445
20	NC_017393	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825445
21	NC_017393	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387825445
22	NC_017393	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825445
23	NC_017393	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825445
24	NC_017393	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
25	NC_017393	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825445
26	NC_017393	AG	4	8	1175	1182	50 %	0 %	50 %	0 %	387825445
27	NC_017393	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825445
28	NC_017393	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825445
29	NC_017393	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825445
30	NC_017393	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825446
31	NC_017393	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825446
32	NC_017393	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825446
33	NC_017393	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825446
34	NC_017393	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387825446
35	NC_017393	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387825446
36	NC_017393	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387825446
37	NC_017393	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387825446
38	NC_017393	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825446
39	NC_017393	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825446
40	NC_017393	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387825446
41	NC_017393	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825447
42	NC_017393	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	387825447
43	NC_017393	TAG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825447
44	NC_017393	ACA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825447
45	NC_017393	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825447
46	NC_017393	TGGCA	2	10	2330	2339	20 %	20 %	40 %	20 %	387825447
47	NC_017393	AAATGG	2	12	2390	2401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825447
48	NC_017393	TGCT	2	8	2530	2537	0 %	50 %	25 %	25 %	387825447
49	NC_017393	AATTA	2	10	2568	2577	60 %	40 %	0 %	0 %	387825447
50	NC_017393	TGA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825448
51	NC_017393	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825448
52	NC_017393	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	387825448
53	NC_017393	TAG	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825448
54	NC_017393	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825448
55	NC_017393	AGA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825448
56	NC_017393	TA	3	6	2966	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	387825448
57	NC_017393	CTGATA	2	12	2986	2997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825448
58	NC_017393	ATGT	2	8	3016	3023	25 %	50 %	25 %	0 %	387825448
59	NC_017393	TAG	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825448
60	NC_017393	GTAT	2	8	3041	3048	25 %	50 %	25 %	0 %	387825448
61	NC_017393	ATAA	2	8	3123	3130	75 %	25 %	0 %	0 %	387825448
62	NC_017393	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825448
63	NC_017393	TGG	3	9	3152	3160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825448
64	NC_017393	CCA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825448
65	NC_017393	TAAT	2	8	3172	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	387825448
66	NC_017393	CT	3	6	3189	3194	0 %	50 %	0 %	50 %	387825448
67	NC_017393	CAAT	2	8	3205	3212	50 %	25 %	0 %	25 %	387825448
68	NC_017393	ATCAAG	2	12	3232	3243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825448
69	NC_017393	TGG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825448
70	NC_017393	ATT	2	6	3390	3395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825449
71	NC_017393	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	387825449
72	NC_017393	ATC	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825449
73	NC_017393	TGG	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825449
74	NC_017393	GAT	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825449
75	NC_017393	AAT	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825449
76	NC_017393	TAG	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825449
77	NC_017393	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825449
78	NC_017393	CAC	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825449
79	NC_017393	TTTA	2	8	3896	3903	25 %	75 %	0 %	0 %	387825449
80	NC_017393	GTAA	2	8	3934	3941	50 %	25 %	25 %	0 %	387825449
81	NC_017393	ATT	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825450
82	NC_017393	TGA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825450
83	NC_017393	ATT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825450
84	NC_017393	TAA	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825450
85	NC_017393	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	387825450
86	NC_017393	ATT	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825450
87	NC_017393	TTA	2	6	4355	4360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825450
88	NC_017393	TTCAA	2	10	4386	4395	40 %	40 %	0 %	20 %	387825450
89	NC_017393	A	6	6	4404	4409	100 %	0 %	0 %	0 %	387825450
90	NC_017393	CTT	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825450
91	NC_017393	AGA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825450
92	NC_017393	GTG	2	6	4481	4486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825450
93	NC_017393	A	6	6	4514	4519	100 %	0 %	0 %	0 %	387825450
94	NC_017393	ATG	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825450
95	NC_017393	GCA	3	9	4621	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825450
96	NC_017393	GCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825450
97	NC_017393	GGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825450
98	NC_017393	TAA	2	6	4692	4697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825450
99	NC_017393	AGA	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825450
100	NC_017393	TTA	2	6	4772	4777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825450
101	NC_017393	TCAT	2	8	4848	4855	25 %	50 %	0 %	25 %	387825450
102	NC_017393	AGG	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825450
103	NC_017393	CTA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825450
104	NC_017393	A	7	7	4959	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	387825451
105	NC_017393	GAA	3	9	4988	4996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825451
106	NC_017393	TTAC	2	8	5156	5163	25 %	50 %	0 %	25 %	387825451
107	NC_017393	GTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825451
108	NC_017393	GAATTT	2	12	5210	5221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825451
109	NC_017393	A	6	6	5231	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	387825451
110	NC_017393	TGAACT	2	12	5248	5259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825451
111	NC_017393	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825451
112	NC_017393	TAG	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825451
113	NC_017393	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825451
114	NC_017393	GGC	2	6	5294	5299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387825451
115	NC_017393	G	6	6	5302	5307	0 %	0 %	100 %	0 %	387825451
116	NC_017393	TG	3	6	5387	5392	0 %	50 %	50 %	0 %	387825451
117	NC_017393	AATG	2	8	5403	5410	50 %	25 %	25 %	0 %	387825451
118	NC_017393	TGT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825452
119	NC_017393	TTC	2	6	5517	5522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825452
120	NC_017393	AG	3	6	5528	5533	50 %	0 %	50 %	0 %	387825452
121	NC_017393	AAAT	2	8	5544	5551	75 %	25 %	0 %	0 %	387825452
122	NC_017393	TTA	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825452
123	NC_017393	TGG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825453
124	NC_017393	TAG	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825453
125	NC_017393	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	387825453
126	NC_017393	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825453
127	NC_017393	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	387825453
128	NC_017393	CTA	2	6	6021	6026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825453
129	NC_017393	AAGT	2	8	6068	6075	50 %	25 %	25 %	0 %	387825453
130	NC_017393	GCA	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825453
131	NC_017393	TTG	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825453
132	NC_017393	AAT	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825454
133	NC_017393	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825454
134	NC_017393	ATA	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825454
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136	NC_017393	AT	3	6	6547	6552	50 %	50 %	0 %	0 %	387825454
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